Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11499/56569
Title: Bakterilerin yağ-su ara yüzü ile etkileşimlerinin incelenmesi
Other Titles: Investigation of the interactions of bacteria with the oil-water interface
Authors: Orhan, Tuğçe Yağmur
Advisors: Vural, Caner
Keywords: Biyodegradasyon
biyosürfaktan
yağ/su ara yüzü
biyofilm
kemotaksi
n-dekan
Biodegradation
biosurfactant
oil/water interface
biofilm
chemotaxis
n-decane
Abstract: Bu çalışmada, çevresel örneklerden n-dekana en iyi ve hızlı adsorbe olma yeteneği olan bakteriler izole edilerek, çeşitli fizikokimyasal ve moleküler biyolojik parametreler ile bakteri n-dekan/su ara yüzü etkileşimleri incelenmiştir. Bu amaçla, n-dekan/su ara yüzünde tutunan 12 bakteriyel izolat (Pseudomonas putida OW1, Rhodococcus qingshengii OW2, Prescotella equi OW3, Brevibacillus parabrevis OW4, Paenibacillus lautus OW5, Paenibacillus lautus OW6, Moraxella osloensis OW7, Stutzerimonas stutzeri OW8, Stutzerimonas stutzeri OW9, Stutzerimonas stutzeri OW10, Rhodococcus ruber OW11, Rhodococcus erythropolis OW12) tanılanmıştır. Bu izolatların hidrokarbon parçalama (YPO), hidrokarbona bakteriyel adsorpsiyon testi (HBA), biyosürfaktan tarama analizleri (emülsifikasyon indeksi testi, yağ yayma testi, CTAB agar petri testi), kemotaksi testi, degradasyon ve biyosürfaktan gen analizleri ve n-dekan/su ara yüzünde oluşan biyofilmin reolojik özelliklerinin belirlenmesi amacıyla bazı analizler (FESEM, Pendant drop vb.) gerçekleştirilmiştir. YPO analizine göre tüm izolatların n-dekanı parçalayabildiği tespit edilmiştir. En yüksek %97, en düşük %79 oranında parçalama olduğu tespit edilmiştir. HBA testine göre OW7 ve OW11 suşları dışında diğer suşların hidrofobik olduğu belirlenmiştir. İzolatların hepsinin, farklı kapasitelerde biyosürfaktan ürettikleri gözlemlenmiştir. Yarı-katı ortamda haraketli olan ve hidrokarbona kemotaksi yapan izolatlar tespit edilmiştir. Pseudomonas türlerinin n-dekan/su ara yüzüne hızla adsorbe olduğu ve stabil ve elastik biyofilmler oluşturduğu tespit edilmiştir. OW1 suşu hariç tüm izolatlarda alkan degradasyonundan sorumlu alkB ailesine ait genlerin varlığı tespit edilmiştir. Rhodococcus türlerinde ve OW7 suşunda trehaloz lipid üretiminden sorumlu genlerinin varlığı saptanmıştır.
In this study, bacteria with the best and fastest adsorption ability to n-decane were isolated from environmental samples and various physical-chemical and molecular biological parameters and bacterial n-decane/water interface interactions were investigated. For this purpose, 12 bacterial isolates were identified as Pseudomonas putida OW1, Rhodococcus qingshengii OW2, Prescotella equi OW3, Brevibacillus parabrevis OW4, Paenibacillus lautus OW5, Paenibacillus lautus OW6, Moraxella osloensis OW7, Stutzerimonas stutzeri OW8, Stutzerimonas stutzeri OW9, Stutzerimonas stutzeri OW10, Rhodococcus ruber OW11, Rhodococcus erythropolis OW12, which adhered at the n-decane/water interface. Hydrocarbon degradation, bacterial adhesion to hydrocarbon test (BATH), biosurfactant screening analyses (emulsification index test, oil displacement test, CTAB agar plate test), chemotaxis experiment, analyses of degradation and biosurfactant genes, FESEM and Pendant drop visualizations were performed to determine the rheological properties of the biofilm formed at the n-decane/water interface.Hydrocarbon degradation analyses showed that all isolates have ability to degrade n-decane. The highest rate of degradation was 97% and the lowest rate was 79%. It was observed the, OW7 and OW11 isolates are not hydrophobic whereas the other isolates are hydrophobic. Besides, all isolates produced biosurfactant at diverse levels. It was detecte d that the Pseudomonas genus rapidly adsorbed to the ndecane/ water interface and formed stable and elastic biofilms with mobility and chemotaxis experiments. Also, presence of alkB genes which responsible for alkane degradation was detected in all isolates except strain OW1. The presence of genes responsible for trehalolipid production was proved in members of Rhodococcus genus and strain OW7.
Description: Bu tez çalışması Pamukkale Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Projeleri Koordinatörlüğü tarafından 2022FEBE014 nolu proje ile desteklenmiştir.
URI: https://hdl.handle.net/11499/56569
Appears in Collections:Tez Koleksiyonu

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
10444666.pdf26.63 MBAdobe PDFView/Open
Tezlerin Erisime Acilmasi ve Kisitlanmasi Hk..pdf
  Restricted Access
479.27 kBAdobe PDFView/Open    Request a copy
Show full item record



CORE Recommender

Page view(s)

106
checked on Aug 24, 2024

Download(s)

14
checked on Aug 24, 2024

Google ScholarTM

Check





Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.