Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11499/35296
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorŞimşek, Ömer-
dc.contributor.authorBıyıklı, Ayşe-
dc.date.accessioned2020-09-25T08:08:52Z-
dc.date.available2020-09-25T08:08:52Z-
dc.date.issued2020-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11499/35296-
dc.description.abstractLaktik asit bakterileri (LAB) tarafından sentezlenen, GH70 enzim ailesi içinde karakterize edilmiş enzim olan 4,6 ?-glukanotransferazlar (4,6-AGTaz), dünyada karbonhidrat kaynağı olarak selülozdan sonra en fazla miktarda bulunan nişasta ve maltodekstrinler üzerinde katalitik etkiye sahip olması açısından son yıllarda önem kazanmıştır. Bunun yanı sıra 4,6-AGTaz enziminin nişasta üzerindeki spesifik katalitik etkisinin olması teknolojik açıdan fonksiyonel amaçlı kullanılabileceğini de göstermektedir. Yapılan bu çalışmada 4,6-AGTaz enziminin heterolog hücre dışı rekombinant üretilmesi ve elde edilen enzimin aktivitesinin tespiti amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda Lactobacillus reuteri E81 suş genomunda 4,6-AGTaz enzimini kodlayan gtfB (4860 bç) geni, eritromisin dirençlilik geni ve usp45 sinyal serisini içeren pLEB825 plazmidine PnisA promotörü altına yerleşecek şekilde eklenmiştir. Elde edilen rekombinant plazmidin Lactococcus lactis NZ9000’e elektroporasyonu başarılı bir şekilde gerçekleştirilmiştir. 4,6-AGTaz enziminin ilk defa Lactococcus lactis’te in vitro üretimi, elde edilen rekombinant suş Lactococcus lactis PLAC39 ile başarılmıştır. Hücre dışı üretilen 4,6-AGTaz enziminin moleküler ağırlığının yaklaşık 160 kDa olduğu tespit edilmiştir. Saflaştırılan 4,6-AGTaz enziminin bulunduğu reaksiyonlarda maltodekstrin ve amiloz substratları varlığında çeşitli oligosakkaritlerinin oluştuğu ancak söz konusu enzimin maltoz ile reaksiyonları sonrasında çok çeşitli ?-glukan yapılarının oluşmadığı TLC analizinde gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, 4,6-AGTaz enziminin endüstriyel üretimde kullanılmak üzere gıda güvenli üretici rekombinant Lactococcus lactis suşunun eldesi sağlanmıştır.en_US
dc.description.abstractThe enzyme 4,6 ?-glucanotransferases (4,6-AGTase), which is characterized in the GH70 enzyme family synthesized by lactic acid bacteria (LAB), has gained importance in recent years in terms of its catalytic effect on starch and maltodextrins, which are the most carbohydrate source in the world, after cellulose. In addition, the fact that 4,6-AGTase enzyme has a specific catalytic effect on starch shows that it can be used technologically for functional purposes. In this study, it was aimed to produce heterologous extracellular recombinant of 4,6-AGTase enzyme and to determine the activity of the obtained enzyme. For this purpose, firstly, the gtfB gene (4860 bp) encoding the 4,6-AGTase enzyme in the Lactobacillus reuteri E81 strain genome was inserted into the pLEB825 plasmid containing the erythromycin resistance gene and the usp45 signal sequence, located under the PnisA promoter. Electroporation of the obtained recombinant plasmid to Lactococcus lactis NZ9000 has been successfully performed. The in vitro production of 4,6-AGTase enzyme in L. lactis was achieved for the first time with the obtained recombinant strain Lactococcus lactis PLAC39. The molecular weight of the extracellular 4,6-AGTase enzyme was found about 160 kDa. In the reactions involving the purified 4,6-AGTase enzyme, it was observed in TLC analysis that various oligosaccharides were formed in the presence of maltodextrin and amylose substrates, but no various ?-glucan structures were formed after the reaction of the enzyme with maltose. As a result, a food-safe producer of recombinant Lactococcus lactis strain was obtained for use in industrial production of 4,6-AGTase enzyme.en_US
dc.description.sponsorshipBu tez çalışması TÜBİTAK tarafından 218O003 nolu proje ile desteklenmiştir.en_US
dc.language.isotren_US
dc.publisherPamukkale Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subject4,6 ?-Glukanotransferazen_US
dc.subjectLactoccoccus lactisen_US
dc.subjectheterolog hücre dışı üretimen_US
dc.subjectklonlamaen_US
dc.subjectnişastaen_US
dc.subject4,6 ?-Glucanotransferaseen_US
dc.subjectLactoccoccus lactisen_US
dc.subjectheterologous extracellular enzyme productionen_US
dc.subjectcloningen_US
dc.subjectstarchen_US
dc.titleLactococcus lactis’te 4,6 alfa-glukanotransferaz enziminin hücre dışı rekombinant üretimien_US
dc.title.alternativeExtracellular recombinant production of 4,6 alpha-glucanotransferase enzyme in Lactococcus lactisen_US
dc.typeMaster Thesisen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.ownerPamukkale University-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.grantfulltextopen-
item.languageiso639-1tr-
item.openairetypeMaster Thesis-
item.fulltextWith Fulltext-
item.cerifentitytypePublications-
Appears in Collections:Tez Koleksiyonu
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Tez Ayşe BIYIKLI (Ramazan Edition - PDF v8.0) (1).pdf1.29 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

126
checked on Aug 24, 2024

Download(s)

296
checked on Aug 24, 2024

Google ScholarTM

Check





Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.