Trichophyton mentagrophytes ve trichophyton rubrum kökenlerinin FT-IR spektroskopi ile ayrımında Tween-80 etkisi

Abstract

Mikrobiyoloji laboratuvarlarında Trichophyton mentagrophytes ve Trichophyton rubrum en sık tanımlanan iki dermatofit türüdür. Her ne kadar yeni teknolojiler dermatofitlerin tür düzeyinde tanımlanmasına yardımcı olabiliyorsa da, bu yöntemlerin doğrudan uygulanmasında kabul edilebilir sonuçlar için geliştirilmelerine ihtiyaç vardır. FT-IR spektroskopisi ile yapılan önceki araştırmalar, bazı kısıtlılıklarının bulunmasıyla birlikte, bu yöntemin dermatofitlerin tanımlanmasında kullanılabileceğini göstermektedir. Küf mantarlarının ökaryotik karmaşık yapılarından dolayı özellikle FT-IR spektrumdaki organik bağ bölgesi oldukça düzensizlikler göstermektedir. Bu çalışmada, inorganik bir molekül olan Tween-80’in, dermato-fitlerin üreme ortamına ilave edilmesiyle, dermatofitlerin FT-IR spektroskopi analizine etkisi incelenmiştir. Çalışmada, toplam dokuz referans dermatofit kökeni [5 T.mentagrophytes kompleks (T.asteroides CBS 424.63, T.erinacei CBS 344.79, T.erinacei CBS 511.73, T.erinacei CBS 677.86, T.mentagrophytes CBS 110.65) ve farklı morfotipte 4 T.rubrum kompleks (T.fluviomuniense CBS 592.68, T.kuryangei CBS 422.67, T.raubitschekii CBS 102856, T.rubrum CBS 392.58)] incelenmiştir. Tüm kökenler %1 Tween-80 içeren ve içermeyen Sabouraud glukoz agarda üç hafta süreyle çoğaltılmış; inkübasyon sonunda, yüzeyden top- lanan her bir dermatofit kökeni FT-IR spektroskopisi ile incelenmiştir. Tüm ölçümler 4400 ile 400 cm-1 aralığında transmisyon modunda yapılmıştır. Çok sayıda spektral pencere bölgesi, temel bileşenler analizi ve hiyerarşik kümeleme ile incelenerek değerlendirilmiştir. T.mentagrophytes kompleks ve T.rubrum kompleks, beş farklı bölge spektrumlarının ikinci dereceden türevlerin birlikte değerlendirilmesiyle kolaylıkla ayrı olarak gruplandırılmıştır. Çalışmanın diğer bir bulgusu da, Tween-80 ile inkübasyon sonrasında tüm T.mentagrophytes kökenlerinin küf yapılarında lipid bağ bileşimlerinin saptanması olmuş (p= 0.025); bu bağlar T.rubrum kökenlerinde belirlenememiştir (p= 0.269). Sonuç olarak, T.mentagrophytes kompleks kökenlerinin T.rubrum kompleks kökenlerinden FT-IR spektroskopi ile ayrılabilmesi için, kültür ortamına Tween-80 eklenmesinin yeterli olduğu belirlenmiş; bunun nedeninin, kültür ortamından T.mentagrophytes kökenlerinin hücre yapısına geçen lipid bileşikler olduğu düşünülmüştür. Tween-80’in, T.mentagrophytes ve T.rubrum kompleks kökenlerinin FT-IR spektroskopi ile ayrımındaki bu olumlu etkisinin desteklenmesi için, gerek daha fazla sayıda referans köken, gerekse antifungal ilaçlar ve inorganik iyonlar gibi farklı çevresel etkenlerle karşılaşan klinik kökenler ile yapılacak ileri araştırmalara ihtiyaç duyulmaktadır.